4  Homología

Una de las herramientas que mayor uso para la búsqueda de homología de secuencias, es BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), en este módulo la útilidad y manejo de esta herramienta

4.1 🧠 Homología

• Similitud entre secuencias (ADN, ARN o proteínas) debido a que comparte ancestría. Este concepto infiere una relación evolutiva y predicción funcional.
• Si dos secuencias son homólogas, ellos probablemente mantienen una estructura similar o características funcionales, aún si ellas tienen divergencia temporal.

4.1.1 Tipos de homología

• Ortólogos: Genes en diferentes especies que evolucionaron de un gen acentral en común después de un evento de especiación. Suelen mantener la misma función.
• Parálogo: Genes dentro de la misma especie que surgen por un evento de duplicación. Ellos pueden evolucionar a nuevas funciones o se especializan en un subconjunto de la función original.

4.1.2 Herramientas para dectectar homología

• BLAST (Basic Local Alignment Search Tool): permite comparar una secuencia contra una base de datos para encontrar similitudes.

• HMMER: Usa los Modelos Ocultos de Markov (HMMs) para detectar homología remota, particularmente efectiva para motivos conservados.

Mas adelante exploraremos estas herramientas de manera individual.